Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms