Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl3Q9JJR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms