Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc86Q9JJ89 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms