Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FliiQ9JJ28 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms