Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LratQ9JI60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms