Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EefsecQ9JHW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EefsecQ9JHW4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms