Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms