Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms