Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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