Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms