Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm7Q9ESD6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms