Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp29Q9ES63 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp29Q9ES63 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp29Q9ES63 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp29Q9ES63 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp29Q9ES63 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp29Q9ES63 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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