Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms