Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rapgef4Q9EQZ6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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