Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SgshQ9EQ08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms