Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r50Q9EP51 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms