Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms