Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufa8Q9DCJ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufa8Q9DCJ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufa8Q9DCJ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufa8Q9DCJ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms