Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms