Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms