Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms