Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ftsj3Q9DBE9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ftsj3Q9DBE9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ftsj3Q9DBE9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms