Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm2aQ9DAR1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms