Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms