Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl3Q9D8K3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms