Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jam3Q9D8B7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jam3Q9D8B7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms