Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh2d4aQ9D7V1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms