Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms