Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms