Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capns2Q9D7J7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms