Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D727 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D727 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D727 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D727 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D727 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D727 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D727 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms