Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms