Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc94Q9D6J3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms