Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms