Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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