Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lpcat2bQ9D5U0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lpcat2bQ9D5U0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms