Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a3Q9D554 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a3Q9D554 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms