Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al3Q9D4U4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al3Q9D4U4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms