Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms