Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4cQ9D3F6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms