Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snrnp35Q9D384 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snrnp35Q9D384 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snrnp35Q9D384 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snrnp35Q9D384 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snrnp35Q9D384 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snrnp35Q9D384 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snrnp35Q9D384 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snrnp35Q9D384 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms