Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms