Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snapc3Q9D2C9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms