Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms