Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cysrt1Q9D1E4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms