Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd3Q9D176 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms