Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed3Q9D0L1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms