Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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