Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3100002H09RikQ9CXW6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms