Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nip7Q9CXK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms